一、猪粪的处理
在建设猪舍时，要设置专门的粪便储存空间。猪粪的处理通常有三种方式：干清粪、水冲粪、垫草垫料。
干清粪主要使用刮粪板清理猪粪，并采用堆肥发酵将猪粪加工成有机肥出售。这种清粪方式能够达到畜禽养殖标准化的标准和畜牧等政府部门的要求，同时能保障猪舍的环境良好，但人工成本较高，一天就需要刮一次。
水冲粪虽然方便省事，但是产生大量污水，现在已经被逐渐淘汰。
第三种方式是在猪舍的地面铺上一层薄薄的木屑垫料或者稻杆、玉米杆等粉碎垫料，让猪只排泄的粪尿与垫料混合后全部回收。饲养小猪的垫料7天左右回收一次，饲养中大猪则3天左右回收一次，将回收物经由特殊物质制肥转化机制，还可以制成优质有机还原肥料，是环保养猪的好方法。
二、种养结合，增收环保双赢
将猪的排泄物全部流到沼气池，经净化和发酵后，再通过管道将这些上等生物肥抽到囤肥池，然后经管道再浇灌果树和时令蔬菜。由于猪粪经过发酵后的化肥料养分充足，果树的生长不用再施用其它化肥，而且果树的病虫害也减少了很多。而树下套种的各类时令蔬菜，又满足了养猪场对上等青饲料的需求。
三、其他废弃物怎么处理?
1.污水：污水处理系统目前还是需要专业的环保公司来进行设计，比较省钱的方法有“沉砂+水解+三级氧化塘氧化”的水处理工艺。
2.病死猪：从前处理病死猪主要方法有深埋和焚烧，对环境会造成比较大的影响。有的地方在养猪的同时也有鱼塘，不少养殖户就将这些死掉的猪肉进行处理后加工喂鱼，进行无公害处理。死猪肉的这种处理方法有效而利用率最高。猪肉本来就是优质的蛋白资源，而且猪和鱼由于在进化树上差异较大，又不存在两者疾病相互交叉的忧虑。
另外一些养殖户的处理方法更为简洁，直接将死猪投放到猪场的发酵池中，让其在各种细菌作用下慢慢腐烂，最后转化为无公害的沼气。还有一些有果园、苗场的养殖户，将这些死猪肉直接加工成为有机肥料，对增加土壤的肥力也相当有效。